CR de la réunion IADB du 27 septembre.
1. Travaux de thèse présentés :
- Amina - Training convolutional
neural networks for biomedical data analysis: a tensor based
approach
- Tobias - Argument Mining on
Clinical Trials
- Edson - Adverse Drug Reaction
Detection in Clinical Notes
2. Participation aux "Premières journées du programme structurant
« Data Sciences »" d'UCA
IADB sera présenté le mardi 9 septembre de 14h00 à 16h00 (à la villa
Clythia - Fréjus).
4 exposés sont prévus (20-25' chacun afin de laisser la place à des
questions).
- Général : Michel ou Johan
- Analyse linguistique des comptes rendus
cliniques : Serena ou Elena
- A tensor approach for biomedical data analysis
: Vicente
- MLP execution for medical data on cluster of Jetson: Michel
Pour vous inscrire et connaitre le programme complet, c'est ici : http://univ-cotedazur.fr/events/datasciences/fr
3. A faire (d'ici le jeudi 4 octobre 12h00)
Envoyez moi les divers travaux qui sont en lien avec IADB de
près ou de loin, en précisant si ceux-ci sont financés par IADB
ou non.
- Pour une thèse (sauf bien évidemment les
5 déjà identifiées : John, Edson, Tobias, Amina et Raphaël) -->
une ligne de titre de la thèse + financement
- Pour
les stages de master ou ingénieur qui ont eu a priori eu
lieu
- La
personne + le titre du mémoire + une copie du mémoire + le
financement
- Pour
tous :
- les
publications acceptées avec
indication s'il y a mention IADB dans le document.Dans hal, il est
possible d'indiquer que le document fait parti du projet
IADB par exemple en utilisant le champ financement.
- le/les dataset que vous utilisez
en mentionnant si celui-ci peut être utilisé par d'autres
ou s'il ne peut être utiliser que par un seul étudiant.
L'objectif etant pouvoir parler de manière fiable de notre
problème récurrent d'accès aux données.
Rappel : pour les
travaux directement financés par IADB et ceux dont nous
pensons qu'ils sont suffisement proche pour être directement
associé au projet même en l'absence de financement nous devons
inclure la mention : This work is partly funded by the
French government labelled PIA program under its IDEX UCAJEDI
project (ANR-15-IDEX-0001) - il est bien évidemment souhaitable
de citer explicitement les autres financements qui ont permis
cette étude.
4. Informations
complémentaires
- Pascal nous invite à soumettre d'ici le 12 novembre des
papiers à http://www.medinfo-lyon.org/en/call/recos.
Deadline 12 novembre.
- Pascal nous informe que Stefan Darmoni, du CHU de Rouen et du
LIMICS (labo INSERM sur Paris), allait mettre en ligne SUR LE
WEB un espace contenant 600 000 documents de santé déidentifié.
Ce serait bien que Serana fasse le point sur ce qui est
disponible lors d'une prochaine réunion IADB