CR de la réunion IADB du 27 septembre.

1. Travaux de thèse présentés :
- Amina - Training convolutional neural networks for biomedical data analysis: a tensor based approach
- Tobias - Argument Mining on Clinical Trials
- Edson - Adverse Drug Reaction Detection in Clinical Notes

2. Participation aux "Premières journées du programme structurant « Data Sciences »" d'UCA

IADB sera présenté le mardi 9 septembre de 14h00 à 16h00 (à la villa Clythia - Fréjus).
4 exposés sont prévus (20-25' chacun afin de laisser la place à des questions).

Général : Michel ou Johan
Analyse linguistique des comptes rendus cliniques : Serena ou Elena
A tensor approach for biomedical data analysis : Vicente
MLP execution for medical data on cluster of Jetson: Michel

Pour vous inscrire et connaitre le programme complet, c'est ici : http://univ-cotedazur.fr/events/datasciences/fr

3. A faire (d'ici le jeudi 4 octobre 12h00)

Envoyez moi les divers travaux qui sont en lien avec IADB de près ou de loin, en précisant si ceux-ci sont financés par IADB ou non.

Pour une thèse (sauf bien évidemment les 5 déjà identifiées : John, Edson, Tobias, Amina et Raphaël) --> une ligne de titre de la thèse + financement
Pour les stages de master ou ingénieur qui ont eu a priori eu lieu

La personne + le titre du mémoire + une copie du mémoire + le financement

Pour tous :

les publications acceptées avec indication s'il y a mention IADB dans le document.Dans hal, il est possible d'indiquer que le document fait parti du projet IADB par exemple en utilisant le champ financement.
le/les dataset que vous utilisez en mentionnant si celui-ci peut être utilisé par d'autres ou s'il ne peut être utiliser que par un seul étudiant. L'objectif etant pouvoir parler de manière fiable de notre problème récurrent d'accès aux données.

Rappel : pour les travaux directement financés par IADB et ceux dont nous pensons qu'ils sont suffisement proche pour être directement associé au projet même en l'absence de financement nous devons inclure la mention : This work is partly funded by the French government labelled PIA program under its IDEX UCAJEDI project (ANR-15-IDEX-0001) - il est bien évidemment souhaitable de citer explicitement les autres financements qui ont permis cette étude.

4. Informations complémentaires

Pascal nous invite à soumettre d'ici le 12 novembre des papiers à http://www.medinfo-lyon.org/en/call/recos. Deadline 12 novembre.
Pascal nous informe que Stefan Darmoni, du CHU de Rouen et du LIMICS (labo INSERM sur Paris), allait mettre en ligne SUR LE WEB un espace contenant 600 000 documents de santé déidentifié. Ce serait bien que Serana fasse le point sur ce qui est disponible lors d'une prochaine réunion IADB