Gilles Bernot

Techniques de simulation pour la biologie, GB4 BIMB, second semestre 2023-2024

Cours/TD :

• Cours n°1
• Pour ce qui concerne Python, on pourra en particulier regarder ces polycopiés de GB3 :
• pour les définitions de fonctions et procédures, cours n°2 et 3 respectivement
• pour les boucles for et while, cours n°3 et 4
• pour la programmation structurée, cours n°5
• pour les dictionnaires ("enregistrements" dans la plupart des autres langages), cours n°6
• pour les fichiers, cours n°7 et 8
• pour les automates, cours n°9
• et les aventureux pourront trouver un cours de programmation fonctionnelle ici
• Cours n°2
• et récupérez HSIM ici pour le prochain cours SVP
• Cours n°3
• petit mode d'emploi rapide de HSIM, exemple de test de HSIM (une réaction enzymatique)
• exemple de 2 gènes régulateurs réciproques
• exemple avec protéine membranaire (opéron mucus de Pseudomonas aeruginosa)
• exemples de la glycolyse simplifiée et plus complète
• Cours n°4
• Cours n°5