Ecole Jeunes Chercheurs
«Modélisation formelle de réseaux de régulation biologique»
Ile de Porquerolles, du 6 au 11 juin 2010
Tous les cours sont donnés en français
(Les transparents sont en lien via les titres des exposés)
Arrivée : Dimanche 6 juin après-midi
Voir les moyens d'accès.
Lundi 7 juin
- 8h30-9h :
- Accueil
- 9h-12h : (pause café à 10h30)
- Cours d'introduction : Réseaux génétiques de Thomas multivalués et logique temporelle (Gilles Bernot, I3S Sophia Antipolis) [+Article]
- 12h-15h30 :
- Déjeuner et pause
- 15h30-19h : (pause café à 17h)
- Liens entre modélisation continue et modélisation discrètes des réseaux génétiques (Jean-Paul Comet, I3S Sophia Antipolis)
- 19h-19h30 :
- Exposés courts des sujets de recherche des participants
- 19h30 :
- Dîner
Mardi 8 juin
- 8h30-12h : (pause café à 10h)
- Cours d'introduction : modélisation par règles en BioChAM (François Fages, INRIA Rocquencourt)
- 12h-15h30 :
- Déjeuner et pause
- 15h30-19h : (pause café à 17h)
- Contraintes de logique temporelle dans BioChAM (François Fages, INRIA Rocquencourt)
- 19h-20h :
- Dîner
- 20h-21h :
- Cours d'ouverture thématique (calcul formel) : Algèbre différentielle et modélisation en biologie (François Boulier, LIFL Lille) [+Poly]
Mercredi 9 juin
- 8h30-12h : (pause café à 10h)
- Réseaux métaboliques et modes élémentaires (Stefan Schuster, Jena/Allemagne)
- 12h-15h :
- Déjeuner et pause
- 15h-18h30 : (pause café à 16h45)
- Dynamique discrète des réseaux biologiques, cas des circuits de régulation (Élisabeth Rémy, IML Marseille)
- 18h45-19h15 :
- Exposés courts des sujets de recherche des participants et démos d'outils
- 20h :
- Dîner de Gala à l'Alycastre
Jeudi 10 juin
- 8h30-12h : (pause café à 10h)
- Modélisation hybride discrète/continue et contraintes temporelles dans l'analyse des réseaux (Alexander Bockmayr, Berlin/Allemagne)
- 12h-15h30 :
- Déjeuner et pause
- 15h30-19h : (pause café à 17h)
- Modélisation hybride et analyse dynamique des réseaux de régulation génétiques (Olivier Roux, Ecole Centrale de Nantes)
- 19h-20h :
- Dîner
- 20h-21h :
- Cours d'ouverture thématique : Interprétation abstraite dans BioChAM (François Fages, INRIA Rocquencourt)
Vendredi 11 juin
- 8h30-12h : (pause café à 10h)
- Simulation stochastique et Pi calcul pour la modélisation en biologie (Cédric Lhoussaine, LIFL Lille)
- 12h-13h :
- Déjeuner
- 13h-16h30 : (pause café à 14h45)
- Cours d'ouverture thématique (SMA) :
Modélisation individu-centrée de systèmes biologiques complexes et
application à la simulation de l'évolution des réseaux génétiques
bactériens (Guillaume Beslon, INSA Lyon)