Ecole Jeunes Chercheurs

«Modélisation formelle de réseaux de régulation biologique»

Ile de Porquerolles, du 6 au 11 juin 2010


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Tous les cours sont donnés en français
(Les transparents sont en lien via les titres des exposés)


Arrivée : Dimanche 6 juin après-midi

Voir les moyens d'accès.

Lundi 7 juin

8h30-9h :
Accueil
9h-12h : (pause café à 10h30)
Cours d'introduction : Réseaux génétiques de Thomas multivalués et logique temporelle (Gilles Bernot, I3S Sophia Antipolis) [+Article]
12h-15h30 :
Déjeuner et pause
15h30-19h : (pause café à 17h)
 Liens entre modélisation continue et modélisation discrètes des réseaux génétiques (Jean-Paul Comet, I3S Sophia Antipolis)
19h-19h30 :
Exposés courts des sujets de recherche des participants
19h30 :
Dîner

Mardi 8 juin

8h30-12h : (pause café à 10h)
Cours d'introduction : modélisation par règles en BioChAM (François Fages, INRIA Rocquencourt)
12h-15h30 :
Déjeuner et pause
15h30-19h : (pause café à 17h)
Contraintes de logique temporelle dans BioChAM (François Fages, INRIA Rocquencourt)
19h-20h :
Dîner
20h-21h :
Cours d'ouverture thématique (calcul formel) : Algèbre différentielle et modélisation en biologie (François Boulier, LIFL Lille) [+Poly]

Mercredi 9 juin

8h30-12h : (pause café à 10h)
Réseaux métaboliques et modes élémentaires (Stefan Schuster, Jena/Allemagne)
12h-15h :
Déjeuner et pause
15h-18h30 : (pause café à 16h45)
Dynamique discrète des réseaux biologiques, cas des circuits de régulation (Élisabeth Rémy, IML Marseille)
18h45-19h15 :
Exposés courts des sujets de recherche des participants et démos d'outils
20h :
          Dîner de Gala à l'Alycastre

Jeudi 10 juin

8h30-12h : (pause café à 10h)
Modélisation hybride discrète/continue et contraintes temporelles dans l'analyse des réseaux (Alexander Bockmayr, Berlin/Allemagne)
12h-15h30 :
Déjeuner et pause
15h30-19h : (pause café à 17h)
Modélisation hybride et analyse dynamique des réseaux de régulation génétiques (Olivier Roux, Ecole Centrale de Nantes)
19h-20h :
Dîner
20h-21h :
Cours d'ouverture thématique : Interprétation abstraite dans BioChAM (François Fages, INRIA Rocquencourt)

Vendredi 11 juin

8h30-12h : (pause café à 10h)
Simulation stochastique et Pi calcul pour la modélisation en biologie (Cédric Lhoussaine, LIFL Lille)
12h-13h :
Déjeuner
13h-16h30 : (pause café à 14h45)
Cours d'ouverture thématique (SMA) : Modélisation individu-centrée de systèmes biologiques complexes et application à la simulation de l'évolution des réseaux génétiques bactériens (Guillaume Beslon, INSA Lyon)



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